Se considera ecosistema territorial de CTeI a cada uno de los conjuntos de entidades, procesos y factores que existen en los departamentos y el Distrito Capital, como se muestra a continuación, donde:
 
  • Actores o entidades, públicas o privadas, que adelantan actividades de ciencia, tecnología e innovación (CTeI) ya sea que pertenezcan a la academia, el gobierno local, el sector empresarial o la sociedad civil, por ejemplo: instituciones de educación superior, secretarías de planeación departamental o distrital, centros de desarrollo tecnológico, cámaras de comercio, Comités universidad-empresa-estado e investigadores, entre otros.
  • Procesos vitales de interacción que conectan a los actores o entidades entre sí. Comprenden los proyectos, eventos, iniciativas, agendas y demás actividades de ciencia, tecnología e innovación (ACTI) que se llevan a cabo para concretar la CTeI en el territorio, por ejemplo: proyectos de inversión presentados al Fondo de CTeI del Sistema General de Regalías (SGR), iniciativas propias de cada departamento enmarcadas en los focos priorizados en CTeI, aprovechamiento de la oferta institucional de Colciencias y gestiones para cooperación internacional, entre otros.
  • Ambiente o entorno territorial, en el que se acumula la historia particular de cada departamento y de Bogotá, en materia de CTeI, esto incluye las características físicas, económicas, sociales y culturales del territorio, que influyen directa o indirectamente en la gestión y desarrollo de las ACTI, los indicadores que reflejan el estado del territorio en esta materia, sus vocaciones empresariales, su trayectoria en investigación, sus necesidades y potencialidades, oportunidades y amenazas, fortalezas y debilidades. Por ejemplo: el índice departamental de competitividad (IDIC), el índice de gestión de proyectos de regalías (IDGR), los indicadores de CTeI del Observatorio Colombiano de CTeI (OCyT) y los resultados de las encuestas de desarrollo e innovación tecnológica (EDIT) generadas por el DANE -para los sectores y territorios que aplique-, entre otros.

Desde Gestión Territorial, se contribuirá con la mejora de los ecosistemas territoriales, planeando, ejecutando y evaluando estrategias que concreten un acompañamiento integral, destinado a contribuir con el logro de los objetivos en CTeI planteados en cada territorio, a partir de tres frentes de trabajo:
 
  • Fortalecimiento de los ecosistemas territoriales de CTeI 
  • Consejos departamentales en CTeI (CODECTI)
  • Planes y Acuerdos estratégicos departamentales (PAED) en CTeI